Ingénieur d’études
Chargé de collections muséales
Laboratoire Biogéosciences (UMR CNRS / uB 6282)
Equipe Samba
UFR Sciences de la Vie, de la Terre et de l’Environnement
Université de Bourgogne
6 boulevard Gabriel
21000 Dijon
Tél : 03 80 39 37 69
Fax : 03 80 39 63 87
Email :jerome.thomas@u-bourgogne.fr
RESPONSABILITES
Missions régulières
– Membre du service Données-Capteurs-Collections, en charge du pôle Collections depuis 2020
– Responsable du Service des Collections du laboratoire Biogéosciences de 2004 à 2020
– Représentant de l’université de Bourgogne au Comité Exécutif du GIS Récolnat depuis 2020 (membre du groupe de travail Géosciences)
– Coordinateur national du work-package « Collections zoologiques et paléontologiques » du programme e-Récolnat (lauréat de l’appel à projet Infrastructures Nationales en Biologie et Santé du Programme d’Investissements d’Avenir) de 2013 à 2020
– Coordinateur du réseau national Trans’Tyfipal® d’inventaire des spécimens types et figurés paléontologiques conservés en France de 2004 à 2013
Missions ponctuelles
– Photographie pour des articles scientifiques
– Expert MESR au sein des jurys de concours de recrutement des personnels ITRF, BAP F, spécialité « Information scientifique et technique, collections patrimoniales » depuis 2011
– Membre élu du Conseil de l’OSU THETA depuis 2020
– Conseiller membre du bureau de l’Association Paléontologique Française de 2012 à 2014, membre du comité d’organisation du congrès APF 2017 à Dijon
– Membre du comité d’expertise AERES du Centre de Recherche sur la Paléobiodiversité et les Paléoenvironnements (CR2P) UMR 5143 du MNHN (25 et 26 mars 2008)
– Vice-Président de la section SGF-Géole (Diffusion des Sciences de la Terre) de 2007 à 2009, membre du Comité d’organisation de la Réunion des Sciences de la Terre Dijon 2006 du 4 au 8 décembre 2006, logistique matérielle
– Responsable du symposium « Patrimoine géologique : conservation et valorisation », Réunion des Sciences de la Terre Dijon 2006
– Membre élu du Conseil et du Bureau de l’UFR des Sciences de la Vie, de la Terre et de l’Environnement (SVTE) de l’université de Bourgogne de 2008 à 2011
– Membre élu de la Commission Recherche de l’UFR des Sciences de la Vie, de la Terre et de l’Environnement (SVTE) de l’université de Bourgogne de 2011 à 2015
– Correspondant Communication CNRS de l’unité de 2007 à 2011
– Membre de la Commission Culture de l’Université de Bourgogne de 2005 à 2009
RECHERCHE
Membre de l’équipe SAMBA
Recherches sur les biais de constitution des collections paléontologiques
VALORISATION SCIENTIFIQUE
Publications (orcid : 0000-0002-1602-4416)
– KURSHID B., LESNIEWSKA E., POLACCHI L., L’HERONDE M., JACKSON D., MOTREUIL S., THOMAS J., BARDEAU J.-F., WOLF S., VIELZEUF D., PERRIN J. & MARIN F., 2023. In situ mapping of biomineral skeletal proteins by molecular recognition imaging with antibody-functionalized AFM tips. Acta Biomateriala, 168, p. 198-209.
– LOMBARDI C., KUKLINSKI P., SPIRANDELLI E., BRUZZONE G., RAITERI G., BORDONE A., MAZZOLI C., LOPEZ CORREA M., VAN GELDERN R., PLASSERAUD L., THOMAS J. & MARIN F., 2023. Antarctic Bioconstructional Bryozoans from Terra Nova Bay (Ross Sea): Morphology, Skeletal Structures and Biomineralization. Minerals, 13 (2), 246.
– KURSHID B., JACKSON D., ENGILBERGE S., MOTREUIL S., BROUSSARD C., THOMAS J., IMMEL F., HARRINGTON M., CROWLEY P., VIELZEUF D., PERRIN J. & MARIN F., 2022. Molecular characterization of accripin11, a soluble shell protein with an acidic C-terminus, identified in the prismatic layer of the Mediterranean fan mussel Pinna nobilis (Bivalvia, Pteriomorphia). FEBS Open Bio, 13 (1), p. 10-25.
– THOMAS J., 2021. Le Sinémurien de l’Auxois dans les collection. In: NEIGE P. & DOMMERGUES J.-L. (coord.) : Stratotype Sinémurien. Muséum national d’histoire naturelle, Paris ; 320 p. (Stratotypes ; 1), p. 288-290.
– BOUILLOT-CHARTIER A. & THOMAS J., 2021. La conservation des spécimens paléontologiques : une muséographie d’origine. In: NEIGE P. & DOMMERGUES J.-L. (coord.) : Stratotype Sinémurien. Muséum national d’histoire naturelle, Paris ; 320 p. (Stratotypes ; 1), p. 284-287.
– BOUILLOT-CHARTIER A. & THOMAS J., 2021. La collection de paléontologie du musée de Semur-en-Auxois. In: NEIGE P. & DOMMERGUES J.-L. (coord.) : Stratotype Sinémurien. Muséum national d’histoire naturelle, Paris ; 320 p. (Stratotypes ; 1), p. 278-283.
– SAKALAUSKAITE J., PLASSERAUD L., THOMAS J., ALBERIC M., THOURY M., PERRIN J., JAMME F., BROUSSARD C., DEMARCHI B. & MARIN F., 2020. The shell matrix of the european thorny oyster, Spondylus gaederopus: microstructural and molecular characterization. Journal of Structural Biology, 211 (1), 107497.
– SAKALAUSKAITE J., ANDERSEN S.H., BIAGI P., BORRELLO M.A., COCQUEREZ T., COLONESE A.C., DAL BELLO F., GIROD A., HEUMULLER M., KOON H., MANDILI G., MEDANA C., PENKMAN K.E.H., PLASSERAUD L., SCHLICHTHERLE H., TAYLOR S., TOKARSKI C., THOMAS J., WILSON J., MARIN F. & DEMARCHI B. 2019. ‘Palaeoshellomics’ reveals the use of freshwater mother-of-pearl in prehistory. eLife, 8 : e45644.
– SCHMITT N., MARIN F., THOMAS J., PLASSERAUD L. & DEMOY-SCHNEIDER M. 2018. Pearl grafting: tracking the biological origin of nuclei by straightforward immunological methods. Aquaculture Research, 49, (2) : 692-700.
– THOMAS J. & AMEDRO F. 2018. Le Turonien du Saumurois et de la Touraine dans les collections. In: Stratotype Turonien (Eds: F. Amédro, B. Matrion & F. Robaszynski), MNHN & Biotope Editions : 349-356.
– AUDIBERT C. & THOMAS J., 2014. Une autre collection de mulettes de Drouët à l’université de Bourgogne : la collection « Henri Miot ». Folia conchyliologica, 27, p.4-7.
– THOMAS J., 2014. Vu du côté des bases : le recueil des données par Trans’Tyfipal®. La Lettre de l’OCIM, n°153, pp.84-85.
– THOMAS J., GUIRAUD M., DINEUR H., FARA E. & DAVID B., 2012. Evaluating museum collections biases: potential impacts on palaeobiodiversity studies. Terra Nostra – Schriften der GeoUnion Alfred Wegener Stiftung, 2012/3, p.178.
– THOMAS J., 2010. Collections universitaires et paléontologie. La Lettre de l’OCIM, n°129, pp.28-35.
– THOMAS J., 2010. Service des collections du laboratoire Biogéosciences-Dijon. Journal de l’Association Paléontologique Française, n°58, pp.68-73.
– THOMAS J. & RICAUD P., 2009. L’imaginaire dans les revues scientifiques. BioED 2008, IUBS International Union of Biological Science, Université de Bourgogne, juin 2008 (Cdrom).
– FLEURY C., MARIN F., MARIE B., LUQUET G., THOMAS J., JOSSE C., SERPENTINI A. & LEBEL J.-M., 2008. Shell repair process in the green ormer Haliotis tuberculata: a histological and microstructural study. Tissue & Cell, 40, (3) : 207-218.
– THOMAS J., MONTUIRE S. & FESTEAU A., 2005. Trans’Tyfipal : inventaire national des types et figurés paléontologiques conservés en France. In HANZO M. (coord) : L‘Hettangien à Hettange, de la science au patrimoine, Hettange, 1-3 avril 2005. Nancy, Univ. Henri Poincarré, pp.135-138.
– PRIEUR A. & THOMAS J., 2004. Gestion pratique des collections. CNRS-Formation, Manuel d’accompagnement au stage de « Gestion pratique des collections », (inédit).
– PRIEUR A., THOMAS J. & PODEVIGNE N., 2003. Numérisation et mise sur le réseau des collections de Paléontologie. Journal de l’Association Paléontologique Française, n° 45, p.37-51, 9 fig.
Congrès avec COMMUNICATION
– Réunion des Sciences de la Terre (Rennes, 2 novembre 2023)
– 11th European Conference on Echinoderms (Lyon, 19 octobre 2023)
– Colloque Collections de Sciences de la Terre (Villers-sur-Mer, 20 septembre 2022)
– Rencontres inter-OSU EOST-ObAS-THETA (Besançon, 5 juillet 2022)
– Colloque DataBFC 2019, « Science ouverte : initiatives et projets en Bourgogne-Franche-Comté » (Dijon, 21 novembre 2019)
-Rencontres des Musées de Bourgogne-Franche-Comté, « Recherche en réseau, sauvegarde et valorisations des collections : Patrimoine scientifique et technique » (Dijon, 6 novembre 2019)
– 16èmes Rencontres Bourgogne-Franche-Comté Nature, « 6ème extinction des espèces (Saint-Brisson, 18 octobre 2019)
– Réunion des Sciences de la Terre Lille 2018 (Lille, 26 octobre 2018)
– Colloque DataBFC 2017, « Ouvrir et gérer les données de la recherche en Bourgogne Franche-Comté (Besançon, 14 novembre 2017)
– Fédération Française des Sociétés de Sciences Naturelles, « Rencontres naturalistes » (Toulon, 24 avril 2015)
– Fédération Française Amateur de Minéralogie et de Paléontologie, « Amateurs et professionnels en Sciences de la Terre » 2015 (Elbeuf, 13 mars 2015) et 2017 (Dijon, 27 mars 2017)
– Journée d’étude « L’ordre et le temps : collections et musées de paléontologie, d’archéologie et de géologie » (Dijon, 22 janvier 2015)
– Colloque international « Museos universitarios – tradicion y futuro » (Madrid, 3 au 5 décembre 2014)
– Journée d’études AGCCPF Provence-Alpes-Côte d’Azur; Aix-Marseille Université et MNHN, « Fédérer les compétences sur les collections d’histoire naturelle » (Marseille, 15 avril 2014)
– Colloque de la Paläontologische Gesellschaft, session « Taphonomy – Preservation of ecological and biogeographic attributes in the sedimentary record » (Berlin, 27 septembre 2012)
– Rencontre professionnelle « Collections paléontologiques : acquisitions et statuts » (Toulouse, 16 novembre 2011)
– Géo Reg – Forum de la fédération française des géosciences (Villeneuve d’Ascq, 26 octobre 2011)
– Rencontre professionnelle « Dans la jungle des bases de données des collections naturalistes » (Paris, 23 juin 2011)
– Colloques de l’Association Paléontologique Française : 2007 (Digne les Bains, 4 mai 2007), 2009 (Lille, 3 juin 2009), 2011 (Elbeuf, 19 mai 2011), 2013 (Toulouse, 10 au 13 avril 2013) et 2015 (Bâle, 8 mai 2015)
– Colloque Universeum 2009 (Toulouse, 12 juin 2009)
– Colloque IUBS-BioEd 2008 : » Développement durable, éthique et éducation pour les années 2020. Quels défis pour la biologie ? » (Dijon, 27 juin 2008)
– Conseil International des Musées (ICOM), section spécialisée du Comité international pour les musées et les collections universitaires (UMAC) 2007 (Vienne, Autriche, 22 août 2007)
– Réunion des Sciences de la Terre Dijon 2006 (Dijon, du 4 au 8 décembre 2006), Caen 2016 (Caen, 27 octobre 2016) et Lille 2018 (Lille, 26 octobre 2018)
– 1ère rencontre sur la valorisation et la préservation du patrimoine paléontologique (Marrakech, 28 avril 2006)
– Journées Georges Ubaghs (Dijon, 30 janvier 2006)
– Journées SGF-Géole, Bourg d’Oisans-2005 et Paris-2007
– Ateliers Quartz, Structuration et mise en ligne des ressources géologiques (Nice, mai 2005)
– L’Hettangien à Hettange, de la science au patrimoine (Hettange, avril 2005)
– Journées nationales d’études et de réflexion sur le patrimoine scientifique des Universités (Montpellier, 18 novembre 2004)
Intervenant dans différentes formations
– Master 2 Géobiosphère puis SP2G « Gestion des échantillons : législation, conservation et diffusion », Université de Bourgogne depuis 2009
– Formation CNRS « Gestion pratique des collections », Université Claude Bernard Lyon 1 en 2004, 2005, 2006, 2007, 2009 et 2011
– Stage « Gestion pratique des collections », Agadir, Maroc, 9 novembre 2006
– Formation OCIM « Internet et les bases de données des collections scientifiques et techniques », Dijon, 15 septembre 2004
VULGARISATION SCIENTIFIQUE
– Conseiller pour l’exposition « Fossiles, naissance d’une science » (Musée de Montbard 2016 et musée Borda de Dax, 2018)
– Conseiller pour « Nocturne éduiante » (Musée Magnin, 16 avril 2015)
– Participation au documentaire « Paléontologie : une histoire d’ammonite » dans la série Visite des collections, réalisé par la Mission Culture Scientifique de l’Université de Bourgogne en 2009
– Conseiller pour l’exposition inaugurale de Latitude 21 (Maison de l’architecture et de l’environnement du Grand Dijon) : « Dessine-moi une agglo… » en 2008
– Organisation de la participation de Biogéosciences aux différentes Fête de la Science depuis 2006
– Conseiller pour le documentaire « Oursin en Antarctique » réalisé par la Mission Culture Scientifique de l’Université de Bourgogne en 2007