Biodiversité cryptique en Europe occidentale en relation aux fluctuations climatiques de la fin du Quaternaire – l’exemple des campagnols agrestes

Financement : EPHE et Graduate School Transbio

Débutée en octobre 2022

Encadrement: Sophie Montuire & Aurélie Khimoun

Résumé

Les changements environnementaux drastiques qui se sont produits au cours des derniers cycles glaciaires offrent des expériences naturelles pour étudier les réponses réalisées par les espèces actuelles aux changements majeurs de leur environnement. L’identification de nombreuses lignées moléculaires cryptiques en Europe occidentale dans de nombreux groupes taxinomiques et en particulier chez les rongeurs campagnols suggère l’existence de radiations non-adaptatives en relation avec ces événements climatiques. Le projet de thèse cherchera ainsi à inférer, au niveau du complexe d’espèces de Microtus agrestis, la démographie et l’évolution de ces entités cryptiques, lesquelles présentent parfois des aires de répartition disjointes et des zones de contact secondaires en Bourgogne Franche-Comté. Ces unités se seraient individualisées autour de l’événement climatique du Younger Dryas (12 kyr). Ce projet en associant génomique des populations, morphométrie et isotopie permettra d’étudier les mécanismes qui ont conduit à l’isolement génétique et à ces événements de spéciation rapide. Les inférences évolutives se feront à partir de données de génomes complets depuis l’ADN extrait des dents. Une extension du projet concernera l’ADN ancien au cours des derniers millénaires cette espèce étant observée en abondance dans les localités fossilifères d’Europe occidentale.

Mots-clés

biologie évolutive, écologie, environnement, diversité cryptique, génétique, morphométrie géométrique

extrait:

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Biodiversité cryptique en Europe occidentale en relation aux fluctuations climatiques de la fin du Quaternaire – l’exemple des campagnols agrestes

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octobre 2022

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Biodiversité cryptique en Europe occidentale en relation aux fluctuations climatiques de la fin du Quaternaire – l’exemple des campagnols agrestes

Financement : EPHE et Graduate School Transbio

Débutée en octobre 2022

Encadrement: Sophie Montuire & Aurélie Khimoun

 

Résumé

Les changements environnementaux drastiques qui se sont produits au cours des derniers cycles glaciaires offrent des expériences naturelles pour étudier les réponses réalisées par les espèces actuelles aux changements majeurs de leur environnement. L’identification de nombreuses lignées moléculaires cryptiques en Europe occidentale dans de nombreux groupes taxinomiques et en particulier chez les rongeurs campagnols suggère l’existence de radiations non-adaptatives en relation avec ces événements climatiques. Le projet de thèse cherchera ainsi à inférer, au niveau du complexe d’espèces de Microtus agrestis, la démographie et l’évolution de ces entités cryptiques, lesquelles présentent parfois des aires de répartition disjointes et des zones de contact secondaires en Bourgogne Franche-Comté. Ces unités se seraient individualisées autour de l’événement climatique du Younger Dryas (12 kyr). Ce projet en associant génomique des populations, morphométrie et isotopie permettra d’étudier les mécanismes qui ont conduit à l'isolement génétique et à ces événements de spéciation rapide. Les inférences évolutives se feront à partir de données de génomes complets depuis l'ADN extrait des dents. Une extension du projet concernera l’ADN ancien au cours des derniers millénaires cette espèce étant observée en abondance dans les localités fossilifères d’Europe occidentale.

 

Mots-clés

biologie évolutive, écologie, environnement, diversité cryptique, génétique, morphométrie géométrique