Analyse intégrée de données fossiles et actuelles, morphologiques et moléculaires pour comprendre l’évolution écologique et biogéographique du genre Arbacia Gray, 1835 (Echinoidea) au cours du Cénozoïque

Débutée en octobre 2021

Financement : bourse doctorale

Direction : Thomas Saucède (uB) et Elie Poulin (université du Chili)

Résumé

Les patrons de distribution géographique des espèces sont déterminés par un ensemble de facteurs écologiques et historiques qui interagissent entre eux à des échelles de temps et d’espace multiples. Longtemps traités séparément, ces facteurs sont aujourd’hui analysés conjointement dans des études biogéographiques qui intègrent les informations phylogénétiques, géographiques et écologiques, notamment en combinant des méthodes de modélisation de niche écologique et de biogéographie historique pour mieux comprendre la distribution des espèces et en cerner leurs facteurs déterminants. Cela nécessite toutefois de pouvoir disposer de phylogénies robustes qui intègrent données morphologiques et moléculaires, actuelles et fossiles. Le sujet de thèse portera sur l’étude du genre d’oursin Arbacia Gray, 1835 qui compte une vingtaine d’espèces actuelles et fossiles aux aires de distribution contrastées le long des côtes nord et sud-américaines, de Méditerranée et d’Afrique de l’ouest, ainsi qu’autour des îles de l’Atlantique. La thèse aura pour principal objectif de tester et mettre en évidence le rôle respectif des facteurs écologiques et historiques majeurs pour l’histoire biogéographique du genre Arbacia et s’articulera autour de trois volets : (1) l’obtention d’une phylogénie moléculaire et morphologique intégrant espèces actuelles et fossiles, (2) le test de différents scénarios biogéographiques sur la base de la phylogénie établie et de données géologiques pour déterminer l’impact des changements environnementaux, paléo-océanographiques et paléogéographiques passés sur l’évolution du genre, et (3) la modélisation des niches écologiques pour caractériser l’importance du conservatisme écologique au regard de la structuration phylogénétique. La thèse sera réalisée en co-tutelle entre l’université de Bourgogne Franche-Comté et l’université du Chili à Santiago. Basée principalement au laboratoire Biogéosciences, elle donnera lieu à des séjours de recherche à Santiago pour les travaux moléculaires et l’accès au matériel d’étude.

Mots clés

biogéographie, écologie marine, modélisation, paléontologie, Echinoidea, Cénozoïque

Comité de suivi de thèse

Gilles Escarguel (université de Lyon Paul Bernard)
Rémi Wattier (uB)

extrait:

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titre:

Analyse intégrée de données fossiles et actuelles, morphologiques et moléculaires pour comprendre l'évolution écologique et biogéographique du genre Arbacia Gray, 1835 (Echinoidea) au cours du Cénozoïque

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octobre 2021

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Courville

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202110

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Analyse intégrée de données fossiles et actuelles, morphologiques et moléculaires pour comprendre l'évolution écologique et biogéographique du genre Arbacia Gray, 1835 (Echinoidea) au cours du Cénozoïque

Débutée en octobre 2021

Financement : bourse doctorale

Direction : Thomas Saucède (uB) et Elie Poulin (université du Chili)

 

Résumé

Les patrons de distribution géographique des espèces sont déterminés par un ensemble de facteurs écologiques et historiques qui interagissent entre eux à des échelles de temps et d'espace multiples. Longtemps traités séparément, ces facteurs sont aujourd'hui analysés conjointement dans des études biogéographiques qui intègrent les informations phylogénétiques, géographiques et écologiques, notamment en combinant des méthodes de modélisation de niche écologique et de biogéographie historique pour mieux comprendre la distribution des espèces et en cerner leurs facteurs déterminants. Cela nécessite toutefois de pouvoir disposer de phylogénies robustes qui intègrent données morphologiques et moléculaires, actuelles et fossiles. Le sujet de thèse portera sur l'étude du genre d'oursin Arbacia Gray, 1835 qui compte une vingtaine d'espèces actuelles et fossiles aux aires de distribution contrastées le long des côtes nord et sud-américaines, de Méditerranée et d'Afrique de l'ouest, ainsi qu'autour des îles de l'Atlantique. La thèse aura pour principal objectif de tester et mettre en évidence le rôle respectif des facteurs écologiques et historiques majeurs pour l'histoire biogéographique du genre Arbacia et s'articulera autour de trois volets : (1) l'obtention d'une phylogénie moléculaire et morphologique intégrant espèces actuelles et fossiles, (2) le test de différents scénarios biogéographiques sur la base de la phylogénie établie et de données géologiques pour déterminer l'impact des changements environnementaux, paléo-océanographiques et paléogéographiques passés sur l'évolution du genre, et (3) la modélisation des niches écologiques pour caractériser l'importance du conservatisme écologique au regard de la structuration phylogénétique. La thèse sera réalisée en co-tutelle entre l'université de Bourgogne Franche-Comté et l'université du Chili à Santiago. Basée principalement au laboratoire Biogéosciences, elle donnera lieu à des séjours de recherche à Santiago pour les travaux moléculaires et l'accès au matériel d'étude.

 

Mots clés

biogéographie, écologie marine, modélisation, paléontologie, Echinoidea, Cénozoïque

 

Comité de suivi de thèse

Gilles Escarguel (université de Lyon Paul Bernard)
Rémi Wattier (uB)